Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttf1Q62187 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttf1Q62187 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms