Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phox2aQ62066 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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