Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf1Q61999 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Odf1Q61999 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Odf1Q61999 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Odf1Q61999 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Odf1Q61999 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Odf1Q61999 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Odf1Q61999 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Odf1Q61999 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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