Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Npm1Q61937 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Npm1Q61937 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Npm1Q61937 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms