Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Itga6Q61739 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itga6Q61739 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms