Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cd47Q61735 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cd47Q61735 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cd47Q61735 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Cd47Q61735 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cd47Q61735 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cd47Q61735 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd47Q61735 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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