Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccne1Q61457 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccne1Q61457 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms