Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pik3c2aQ61194 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pik3c2aQ61194 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pik3c2aQ61194 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms