Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trpc1Q61056 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trpc1Q61056 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms