Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Meis1Q60954 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Meis1Q60954 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms