Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Stxbp3Q60770 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stxbp3Q60770 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms