Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf3Q60765 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf3Q60765 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms