Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ItgaeQ60677 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgaeQ60677 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms