Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nr2f1Q60632 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms