Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc5a6Q5U4D8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc5a6Q5U4D8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms