Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brip1Q5SXJ3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brip1Q5SXJ3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms