Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVL9

Prl2c1, Growth hormone d22, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl2c1Q5SVL9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prl2c1Q5SVL9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prl2c1Q5SVL9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms