Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc42Q5SV66 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc42Q5SV66 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms