Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Psme4Q5SSW2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Psme4Q5SSW2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Psme4Q5SSW2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms