Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Phf12Q5SPL2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Phf12Q5SPL2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms