Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PkdccQ5RJI4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PkdccQ5RJI4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms