Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav6-2Q5R1I4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav6-2Q5R1I4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms