Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms