Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trdv4Q5R1A3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trdv4Q5R1A3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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