Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rtp3Q5QGU6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rtp3Q5QGU6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms