Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttf2Q5NC05 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms