Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CoblQ5NBX1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CoblQ5NBX1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms