Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtl5Q5DTT4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtl5Q5DTT4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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