Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufaf2Q59J78 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufaf2Q59J78 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms