Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2f8Q58FA4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2f8Q58FA4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms