Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3lQ4KL14 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3lQ4KL14 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms