Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm10488Q4KL05 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm10488Q4KL05 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms