Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2al1nQ497L1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms