Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt35Q497I4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt35Q497I4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms