Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5aQ3UXZ9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5aQ3UXZ9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms