Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
D130052B06RikQ3UW13 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms