Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6899Q3USS0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm6899Q3USS0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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