Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm28047Q3US59 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm28047Q3US59 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms