Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cobll1Q3UMF0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cobll1Q3UMF0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms