Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smu1Q3UKJ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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