Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sf3b2Q3UJB0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b2Q3UJB0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms