Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm648Q3UJ22 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm648Q3UJ22 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gm648Q3UJ22 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm648Q3UJ22 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm648Q3UJ22 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm648Q3UJ22 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm648Q3UJ22 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm648Q3UJ22 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm648Q3UJ22 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm648Q3UJ22 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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