Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rrp36Q3UFY0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp36Q3UFY0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms