Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm21748Q3UE70 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Gm21748Q3UE70 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21748Q3UE70 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Gm21748Q3UE70 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm21748Q3UE70 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm21748Q3UE70 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21748Q3UE70 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21748Q3UE70 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21748Q3UE70 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21748Q3UE70 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm21748Q3UE70 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21748Q3UE70 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms