Protein–RNA interactions for Protein: Q3UB74

Tbrg1, Transforming growth factor beta regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbrg1Q3UB74 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbrg1Q3UB74 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms