Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp6Q3U6U5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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