Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q3U595 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q3U595 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q3U595 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q3U595 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q3U595 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q3U595 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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