Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ulk3Q3U3Q1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms