Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otud5Q3U2S4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Otud5Q3U2S4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Otud5Q3U2S4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
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