Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hace1Q3U0D9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms